Ratu Wilhelmina meninggal di Istana Het Loo pada 28 November 1962 di usia 82 tahun.
Saat Indonesia merdeka, ia masih menjabat sebagai penguasa Belanda, hingga Ratu Wilhelmina sangat terpukul dan merana setelah Indonesia merdeka.
Tiga tahun pasca kemerdekaan Indonesia, atau tepatnya 4 September 1948, Sang Ratu menyerahkan tampuk kepemimpinan negeri kincir angin tersebut kepada anak perempuannya, Putri Juliana.*