Dibuat di dinding tebing dari Jalan Denpasar ke pinggiran Semarapura dengan sungai yang disebut Tukad Bubuh di atasnya.
Gua Klungkung dibangun sebagai tempat berlindung tentara Jepang untuk melindungi diri dari serangan musuh dan pejuang nasionalis Indonesia.
Ada 16 lubang cabang dengan kedalaman sekitar 14 meter dan 2 lubang cabang lagi tetapi tidak berhubungan. Satu buah berada di ujung selatan dan yang lainnya di ujung utara, sedangkan lubang lainnya dihubungkan oleh saluran yang memanjang ke selatan dan arah.
Gua Jepang Kaliurang
Gua Jepang Kaliurang, Yogyakarta, berada di lereng Gunung Merapi. Dulunya, gua ini dijadikan sebagai tempat tinggal dan berlindung tentara Jepang.
Selian itu juga masih banyak gua Jepang lainnya, seperti Gua Jepang Bandealit, Jawa Timur, berada di ketinggian 200 meter. Gua ini menyimpan banyak sejarah penjajahan Jepang.
Gua Jepang Kawangkoan, Sulawesi Utara, Gua Jepang Biak, Papua, menjadi tempat berlindung tentara Dai Nippon.
Kemudian ada Gua Jepang Liliba Kupang, Nusa Tenggara Timur (NTT), Gua Jepang Taman Hutan Raya, Bandung, dibangun pada tahun 1942.
Terus Gua Jepang Pangandaran, Jawa Barat terbuat dari tembok beton yang ditimbun oleh tanah serta Gua Jepang Berbah di Dusun Sentonorejo, Yogyakarta.*